MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350 chromosome

Total Repeats: 225524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010572	GCA	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
2	NC_010572	AGA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182433794
3	NC_010572	GA	3	6	1035	1040	50 %	0 %	50 %	0 %	182433794
4	NC_010572	GTG	2	6	1075	1080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182433794
5	NC_010572	GCA	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
6	NC_010572	GCA	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
7	NC_010572	AGG	2	6	1200	1205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182433794
8	NC_010572	GAG	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182433794
9	NC_010572	CCG	3	9	1278	1286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433794
10	NC_010572	CTG	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433794
11	NC_010572	ACGC	2	8	1371	1378	25 %	0 %	25 %	50 %	182433794
12	NC_010572	CCCA	2	8	1391	1398	25 %	0 %	0 %	75 %	182433794
13	NC_010572	CGG	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433794
14	NC_010572	AGC	2	6	1422	1427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
15	NC_010572	TGC	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433794
16	NC_010572	CGA	3	9	1459	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
17	NC_010572	CGAC	2	8	1494	1501	25 %	0 %	25 %	50 %	182433794
18	NC_010572	AAG	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182433794
19	NC_010572	GAA	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182433794
20	NC_010572	TCC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182433794
21	NC_010572	GAG	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182433794
22	NC_010572	GCGCC	2	10	1594	1603	0 %	0 %	40 %	60 %	182433794
23	NC_010572	GCA	2	6	1618	1623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
24	NC_010572	GAA	2	6	1628	1633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182433794
25	NC_010572	GCA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
26	NC_010572	GC	3	6	1724	1729	0 %	0 %	50 %	50 %	182433794
27	NC_010572	GCC	2	6	1733	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433794
28	NC_010572	CAG	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
29	NC_010572	GAC	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
30	NC_010572	GC	3	6	1769	1774	0 %	0 %	50 %	50 %	182433794
31	NC_010572	CTG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433794
32	NC_010572	GGC	2	6	1783	1788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433794
33	NC_010572	TGC	2	6	1789	1794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433794
34	NC_010572	TGCG	2	8	1859	1866	0 %	25 %	50 %	25 %	182433794
35	NC_010572	GAC	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
36	NC_010572	TG	3	6	1906	1911	0 %	50 %	50 %	0 %	182433794
37	NC_010572	CGG	2	6	1913	1918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433794
38	NC_010572	CAG	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
39	NC_010572	CACC	2	8	1942	1949	25 %	0 %	0 %	75 %	182433794
40	NC_010572	GCG	2	6	1957	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433794
41	NC_010572	CAA	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182433794
42	NC_010572	GC	3	6	1990	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	182433794
43	NC_010572	AGC	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
44	NC_010572	CCG	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433794
45	NC_010572	GGC	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433794
46	NC_010572	GCC	2	6	2024	2029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433794
47	NC_010572	GGCCG	2	10	2042	2051	0 %	0 %	60 %	40 %	182433794
48	NC_010572	CCGA	2	8	2058	2065	25 %	0 %	25 %	50 %	182433794
49	NC_010572	CAC	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182433794
50	NC_010572	AGC	2	6	2124	2129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
51	NC_010572	GCC	2	6	2168	2173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433794
52	NC_010572	AAG	2	6	2259	2264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182433794
53	NC_010572	ACCG	2	8	2324	2331	25 %	0 %	25 %	50 %	182433794
54	NC_010572	ACC	2	6	2340	2345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182433794
55	NC_010572	TGC	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433794
56	NC_010572	CAC	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182433794
57	NC_010572	CCGTCA	2	12	2412	2423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	182433794
58	NC_010572	GGA	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182433794
59	NC_010572	TTCGA	2	10	2435	2444	20 %	40 %	20 %	20 %	182433794
60	NC_010572	CTG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433794
61	NC_010572	GCC	2	6	2606	2611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433794
62	NC_010572	CGG	2	6	2662	2667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433794
63	NC_010572	TCA	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182433794
64	NC_010572	GCA	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433794
65	NC_010572	CG	3	6	2769	2774	0 %	0 %	50 %	50 %	182433794
66	NC_010572	AC	3	6	2781	2786	50 %	0 %	0 %	50 %	182433794
67	NC_010572	CGG	2	6	3420	3425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433795
68	NC_010572	CTG	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433795
69	NC_010572	CTG	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433795
70	NC_010572	CCA	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182433795
71	NC_010572	TGA	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182433795
72	NC_010572	TCG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433795
73	NC_010572	CG	3	6	3658	3663	0 %	0 %	50 %	50 %	182433795
74	NC_010572	GAT	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182433795
75	NC_010572	CTCG	2	8	3676	3683	0 %	25 %	25 %	50 %	182433795
76	NC_010572	CACG	2	8	3685	3692	25 %	0 %	25 %	50 %	182433795
77	NC_010572	CCGA	2	8	3704	3711	25 %	0 %	25 %	50 %	182433795
78	NC_010572	GAA	2	6	3725	3730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182433795
79	NC_010572	TCG	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433795
80	NC_010572	CGG	2	6	3771	3776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433795
81	NC_010572	CG	3	6	3813	3818	0 %	0 %	50 %	50 %	182433795
82	NC_010572	AGC	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433795
83	NC_010572	CGT	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433796
84	NC_010572	GCT	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433796
85	NC_010572	GCT	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433796
86	NC_010572	CGGGCG	2	12	4463	4474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433797
87	NC_010572	GGC	2	6	4501	4506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433797
88	NC_010572	GTC	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433797
89	NC_010572	CGA	2	6	4590	4595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433797
90	NC_010572	TCG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433797
91	NC_010572	CAG	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433797
92	NC_010572	CGA	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433797
93	NC_010572	GCT	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433797
94	NC_010572	GCC	3	9	5099	5107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433797
95	NC_010572	TCT	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182433797
96	NC_010572	GCC	2	6	5139	5144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433797
97	NC_010572	GAG	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182433797
98	NC_010572	G	6	6	5287	5292	0 %	0 %	100 %	0 %	182433798
99	NC_010572	CAGC	2	8	5324	5331	25 %	0 %	25 %	50 %	182433798
100	NC_010572	GGC	2	6	5358	5363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433798
101	NC_010572	GCA	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433798
102	NC_010572	GGTGTC	2	12	5406	5417	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	182433798
103	NC_010572	ATGC	2	8	5424	5431	25 %	25 %	25 %	25 %	182433798
104	NC_010572	TGA	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182433798
105	NC_010572	CGG	2	6	5525	5530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433798
106	NC_010572	GGTG	2	8	5574	5581	0 %	25 %	75 %	0 %	182433798
107	NC_010572	TCG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433798
108	NC_010572	GATCCG	2	12	5592	5603	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182433798
109	NC_010572	GGTG	2	8	5780	5787	0 %	25 %	75 %	0 %	182433798
110	NC_010572	CAG	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433799
111	NC_010572	GAC	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433799
112	NC_010572	CGA	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433799
113	NC_010572	GGT	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182433799
114	NC_010572	TCA	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182433800
115	NC_010572	CAG	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433800
116	NC_010572	GCCC	2	8	7240	7247	0 %	0 %	25 %	75 %	182433800
117	NC_010572	TCC	2	6	7353	7358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182433800
118	NC_010572	GGAGA	2	10	7370	7379	40 %	0 %	60 %	0 %	182433800
119	NC_010572	ACC	2	6	7548	7553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182433800
120	NC_010572	CCCT	2	8	7569	7576	0 %	25 %	0 %	75 %	182433800
121	NC_010572	CTGCC	2	10	7583	7592	0 %	20 %	20 %	60 %	182433800
122	NC_010572	CAC	2	6	7742	7747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182433801
123	NC_010572	TAG	2	6	7753	7758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182433801
124	NC_010572	TGAAT	2	10	7791	7800	40 %	40 %	20 %	0 %	182433801
125	NC_010572	ATTCGA	2	12	7829	7840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	182433801
126	NC_010572	CTG	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433801
127	NC_010572	CGC	2	6	7878	7883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433801
128	NC_010572	AGCC	2	8	7992	7999	25 %	0 %	25 %	50 %	182433801
129	NC_010572	CTTCGT	2	12	8016	8027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	182433801
130	NC_010572	TTA	2	6	8071	8076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182433801
131	NC_010572	TG	3	6	8081	8086	0 %	50 %	50 %	0 %	182433801
132	NC_010572	ATA	2	6	8100	8105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182433801
133	NC_010572	TCA	3	9	8110	8118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182433801
134	NC_010572	CGC	2	6	8333	8338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433801
135	NC_010572	CCG	2	6	8446	8451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433801
136	NC_010572	GCC	2	6	8469	8474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433801
137	NC_010572	GTT	2	6	8526	8531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182433801
138	NC_010572	TCT	2	6	8563	8568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182433801
139	NC_010572	GTCGGC	2	12	8649	8660	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	182433801
140	NC_010572	GTC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433801
141	NC_010572	TC	3	6	8717	8722	0 %	50 %	0 %	50 %	182433801
142	NC_010572	GCG	2	6	8739	8744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433801
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148	NC_010572	GTA	2	6	8856	8861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182433801
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150	NC_010572	CGT	2	6	8891	8896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433801
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154	NC_010572	GTG	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182433801
155	NC_010572	TGG	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182433801
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160	NC_010572	CGT	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433801
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164	NC_010572	GCT	2	6	9697	9702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433801
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257	NC_010572	CAGT	2	8	13394	13401	25 %	25 %	25 %	25 %	182433801
258	NC_010572	CGT	2	6	13415	13420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433801
259	NC_010572	CTT	3	9	13458	13466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182433801
260	NC_010572	GC	3	6	13478	13483	0 %	0 %	50 %	50 %	182433801
261	NC_010572	GCC	2	6	13524	13529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182433801
262	NC_010572	CGT	2	6	13535	13540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433801
263	NC_010572	AGT	2	6	13550	13555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182433801
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265	NC_010572	CGG	2	6	13586	13591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433801
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282	NC_010572	GAC	2	6	14131	14136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433801
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284	NC_010572	CTG	2	6	14302	14307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433802
285	NC_010572	GGTGGA	2	12	14338	14349	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	182433802
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370	NC_010572	CAG	2	6	17466	17471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433802
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375	NC_010572	CACG	2	8	17652	17659	25 %	0 %	25 %	50 %	182433802
376	NC_010572	GTG	2	6	17663	17668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182433802
377	NC_010572	GGT	2	6	17773	17778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182433802
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381	NC_010572	CGG	2	6	18496	18501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433803
382	NC_010572	TCG	2	6	18523	18528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433803
383	NC_010572	GC	3	6	18542	18547	0 %	0 %	50 %	50 %	182433803
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385	NC_010572	GCG	2	6	18740	18745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182433803
386	NC_010572	GTT	2	6	18816	18821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182433803
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390	NC_010572	CTG	2	6	19281	19286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433804
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496	NC_010572	CCAGGA	2	12	25229	25240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182433811
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498	NC_010572	GGAG	2	8	25318	25325	25 %	0 %	75 %	0 %	182433811
499	NC_010572	TGC	2	6	25328	25333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182433811
500	NC_010572	CTGC	2	8	25335	25342	0 %	25 %	25 %	50 %	182433811

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